Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH12Q96NR8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms