Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms