Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC136Q96JN2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms