Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms