Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEIL1Q96FI4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms