Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPACA9Q96E40 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPACA9Q96E40 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPACA9Q96E40 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms