Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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