Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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