Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms