Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BBXQ8WY36 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBXQ8WY36 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 786.6 ms