Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GIPC3Q8TF64 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms