Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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TMIEQ8NEW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TMIEQ8NEW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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TMIEQ8NEW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TMIEQ8NEW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TMIEQ8NEW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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TMIEQ8NEW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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