Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms