Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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