Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC63Q8NA47 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms