Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC4Q8N9L1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms