Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms