Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC82Q8N4S0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms