Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWDEQ8N2E2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWDEQ8N2E2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms