Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms