Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms