Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms