Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms