Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3FQ6ZSY5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms