Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms