Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms