Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC25A47Q6Q0C1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms