Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms