Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms