Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms