Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMBQ6NW40 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms