Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLFN12LQ6IEE8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms