Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms