Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms