Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USPL1Q5W0Q7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms