Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GKAP1Q5VSY0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms