Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP1Q5VSL9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms