Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1TD1Q5T7N2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms