Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP2LQ5T4T6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms