Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms