Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms