Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP28Q4G0W2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms