Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms