Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
QSER1Q2KHR3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms