Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MICAQ29983 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms