Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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