Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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