Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NREPQ16612 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms