Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FXNQ16595 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FXNQ16595 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FXNQ16595 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FXNQ16595 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms