Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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